A desvantagem é que materiais termossensíveis ou plásticos delicados não podem ser esterilizados por meio de calor.

A água utilizada no reservatório da autoclave deve ser filtrada ou destilada.

Os pacotes devem ser colocados dentro da autoclave deixando espaços entre eles, permitido a circulação do vapor.

As embalagens de papel grau cirúrgico podem ser reutilizadas.

Os pacotes podem ser fechados com fita adesiva comum ou com seladora automática, contendo identificação do material e data da esterilização.