É o reflexo do desequilíbrio da microbiota da cavidade oral. Condições como doenças sistêmicas, doenças autoimunes, imunossupressão, desequilíbrios nutricionais e hormonais, possibilitam a supremacia e o desenvolvimento de algumas espécies de bactérias potencialmente patogênicas, advindo a inflamação.

É caracterizada pela formação de vesículas nas camadas superficiais do epitélio ou entre o epitélio e a lâmina própria, sendo típica de algumas infecções virais.

É um tipo de estomatite superficial comum e inespecífica que cursa com doenças debilitantes. Caracteriza-se por hiperemia da mucosa e edema, principalmente das fauces posteriores, acompanhados por discreta gengivite. 

É uma enfermidade inflamatória dolorosa e crônica, de patogenia pouco compreendida, que não responde bem aos principais protocolos de tratamento disponíveis atualmente.