Os conflitos originam-se basicamente de fatores intrapessoais e interpessoais, que são respectivamente, os existentes entre os indivíduos e os que se desenvolvem a partir do inter-relacionamento entre os grupos de indivíduos, tendo em vista que, muitas vezes, na relação das organizações com o seu ambiente, existem diferenças entre o papel esperado e o realizado, o que causa conflitos entre os principais sócios.

Os conflitos nas organizações devem-se ao fato de que nem sempre os objetivos dos indivíduos ou de grupos de profissionais coincidem com os objetivos dos órgãos internos e com a organização. Na gestão de projetos, observa-se que os indivíduos necessitam do cumprimento de cronogramas e custos, enquanto as organizações buscam a otimização do trabalho, gerando conflitos entre os profissionais dessas organizações.

Na administração ou gerência de projetos, o projeto tem características que fazem dele um terreno fértil para os conflitos de todos os tipos, devido ao fato de ser o projeto uma organização temporária instalada em uma organização de objetivos mais permanentes, em que os objetivos do projeto não são, necessariamente, os mesmos da organização, podendo gerar conflitos intergrupais.

Os conflitos intrapessoais ocorrem a partir do inter-relacionamento interno entre os diversos setores departamentos e subdivisões existentes nas organizações. Na realidade ocorre quando o marketing quer recursos para a propaganda e publicidade, a produção quer recursos para a inovação em novos produtos, os acionistas querem maiores dividendos e o financeiro quer mais recursos de reserva para imprevistos, gerando conflitos de interesses.

A gestão de projetos requer inter-relacionamento entre indivíduos de diversos tipos de organização que compõem esse projeto, por isso sua administração deve evitar conflitos, principalmente os intrapessoais.