o rio São Francisco nasce na Serra da Canastra, em Minas Gerais; serve, em grande parte do seu curso, de linha divisória entre os Estados de Pernambuco e da Bahia. Em seguida, ele separa a Bahia e Sergipe de Alagoas, até desembocar no oceano Atlântico.

um dos maiores rios do estado é o rio Ipojuca que desemboca na enseada de Suape. Ao descer o maciço da Borborema para a região da Mata, forma a cachoeira do Urubu, atração turística existente no Município de Primavera.

vários dos afluentes do São Francisco nascem e têm todo o seu curso em território pernambucano, como o do Pontal, das Garças, Brígida, Terra Nova, Pajeú e Moxotó.

nas proximidades da Ilha de Santo Aleixo, encontra-se a foz do rio Sirinhaém, mais ao sul do rio Una. Esse rio, o mais importante da Zona da Mata, nasce e atravessa o Agreste e a Mata, desembocando no Atlântico.

o Rio Capibaribe nasce no Município de Poção, drena o Agreste e a Mata até chegar à capital pernambucana. No seu percurso, recebe dois importantes afluentes, o Tapacurá e o Goitá e, próximo à foz , conflui com o Beberibe, oriundo de Olinda.