Para a maioria das doenças, o ciclo das relações patógeno-hospedeiro é composto por cinco processos: sobrevivência, disseminação, infecção, colonização e reprodução.

O ciclo das relações patógeno-hospedeiro é resultante da interação de três fatores: hospedeiro, patógeno e ambiente, sendo definido em fitopatologia pelo triângulo da doença.

O ciclo das relações patógeno-hospedeiro pode ser dividido em ciclo primário e ciclo secundário, sendo que o ciclo secundário se difere por passar pelo processo de sobrevivência.

O processo de sobrevivência é importante para os patógenos nas situações adversas, sendo que os tubos germinativo, haustório e apressório são exemplos de estruturas de sobrevivência dos fungos.

O processo de disseminação apresenta três subprocessos: mecanismos de pré-penetração, penetração e estabelecimento das relações parasitárias estáveis.