Somente com o SMB é possível transferir os dados em ambas as direções.

Os clientes do SMB podem estabelecer uma conexão a longo prazo com o servidor.

Somente o SMB estabelece duas conexões simultâneas com o cliente, tornando a transferência de dados mais rápida.

O SMB é mais seguro do que o FTP, visto que o SMB usa o TCP e o FTP usa o UDP.

Não existe diferença entre esses protocolos, portanto, não existe vantagem de um sobre o outro.